七岁的玛雅（金井美香 配音）非常调皮，这让玛雅的妈妈（麻上洋子 配音）感触非常头痛，于是，她找到了村里闻名的邪术师，向他讨教良方。邪术师给了玛雅的妈妈一本名为《拇指女人》的故事书，在给玛雅念这本书时，玛雅的妈妈睡着了，玛雅也因此变成了拇指巨细，进入了书中的天下。
　　在这里，玛雅遇见了名为席拉（宗形智子 配音）的善良仙女，席拉报告玛雅，在南国住着一位水晶王子，只有他才华唤醒玛雅的妈妈，使玛雅回到原来的天下。就如许，玛雅踏上了前去南国的旅途。途中，玛雅遇见了小精灵布尔（山田恭子 配音），两人结伴而行，随后，田鸡盖洛达也参加了玛雅的步队中去，对他们时时拦阻的，是一个名叫赫鲁拉（麻上洋子 配音）的险恶妖怪。