柯南、灰原及少年侦察队成员步美、光彦、元太随博士这日露营完毕，绕道观光西多摩市新建于富士山前的日本第一双塔摩天大楼，毛利小五郎恰也应双塔全部者、他的学妹常盘美绪之邀，携小兰、园子参加开幕仪式。美绪先容下，他们认识以画富士山闻名的画师如月峰水、市议员大木岩松、双塔的计划者风间英彦（森谷帝二的弟子，第一弹《引爆摩天楼》中，森谷曾向新一挑衅）、天才步伐员原。期间灰原的活动非常。
　　大木提前入住B塔被害，目暮警官动手观察发明他与美绪似有差别平常干系，不久原亦被杀害于家中。由于现场都留有与日本画画师作画时所用的乳钵相似的小羽觞碎片，两起案件似系一人所为。柯南由小羽觞遐想到灰原曾效力的、以酒名为外号的暗中构造，并留意到第二起案件中碎片上未沾染血迹。与此同时他找到灰原活动非常的缘故起因，却发明她正被人追踪。而园子打趣弄的发式令她像极了雪莉（灰原）。
　　开幕酒会上，美绪向来宾展示如月最为宝贵的富士山画作时被杀，死相正如横亘在富士山正中的双塔的缩影图，她的身下也有一个小羽觞，不外却是齐备的。地上一颗本来该呆在美绪脖子上的珍珠令柯南将眼光转向如月。紧接，A楼美绪公司电脑档案地点的楼层及地下配电室产生爆炸。避难时候，柯南留意到正有一支枪对准园子，心中给出了全部疑问的答案，但他及小兰等人最急迫必要办理的却是怎样从火海逃脱。